Man kann das Konfigurationsfile "ArenaENG.cfg" weiterbenutzen. Die Pfade wo die Engines liegen, müssen aber gleich bleiben, d.h. falls sie unter dem Arenaverzeichnis liegen, muss dessen Name derselbe bleiben. Bei mir waren sofort alle Engines wieder da.
(ArenaGUI.cfg übrigens auch, zumindest konnte ich keine Probleme dadurch feststellen.)