Hallo,
die UCI Engines können liegen wo sie wollen, solange Du die Administratorrechte hast. Bei mir liegen sie in C:\Program Files (x86)\ChessBase\Engines. Du kannst sie aber auch von anderen Partitionen aus in Fritz einbinden.
Die entsprechenden UCI Dateien für die jeweilige Engine werden abgelegt in C:\Users\..\AppData\Roaming\ChessBase\Engines.UCI
Gruß
Günther